Ordet molekyl er en diminutiv av det latinske ordet "mol" som betyr masse, så molekyl betyr "liten masse". Et molekyl er foreningen eller settet av to eller flere atomer, som kan være like eller forskjellige. Hvis disse atomene skilles, vil det endre materialets egenskaper.
Et molekyl er et stabilt og elektrisk nøytralt system som består av settet med to eller flere atomer koblet av kjemiske bindinger, som kalles kovalente bindinger. Disse atomer kan være de samme som i tilfelle av hydrogen (H2) og oksygen (O2), som er diatoniske molekyler, eller de kan dannes av forskjellige atomer, slik det er tilfelle med vann (H2O), som består av to hydrogenatomer. og ett av oksygen og metangass (CH4), i hvis molekyl det er fire hydrogenatomer knyttet til ett av karbon.
Den molekylet anses som den minste delen som kan fås fra saken slik at den kan bevare dens kjemiske egenskaper. Hovedårsaken til at molekyler dannes er at det er atomer som har en tendens til å oppnå en minimal energitilstand, og for å oppnå dette gjør det det gjennom kovalente bindinger med andre atomer som har samme tilstand, denne bindingen kan ikke lett oppløses, og det er da et molekyl blir født.
I et stoff er molekylene som komponerer dem ikke statiske, tvert imot, de er i konstant bevegelse, som kalles molekylær vibrasjon, og dette kan igjen være bøyning eller spenning.
