Opphavet til mikroskopet ble gitt at de gamle visste at det å se gjennom buede speil eller glasskuler med vann, fikk små ting til å se med forstørrelse. Det var da de første tiårene av det syttende århundre begynte å utføre tester med linser for å oppnå større forstørrelse av gjenstandene. For dette var de basert på det første instrumentet laget med linser som hadde stor suksess " teleskopet " som ble brukt for første gang i astronomiske formål av Galileo i år 1609.
På begynnelsen av det 20. århundre ble produksjonen av dette hovedsakelig konsentrert i Tyskland, og i de påfølgende årene ble det utviklet fasekontrast, fluorescens, holografi, interferens, røntgenstråler, ultrafiolett lys, metoder med elektroner og protoner. Datastyrte mikroskoper ble også utviklet for kvantifisering, kvantifisering og tredimensjonal analyse, disse instrumentene åpnet mange felt innen mikroskopi. Fra 1660 til i dag har det optiske mikroskopet vært den grunnleggende søylen for studiet av det usynlige. Skjønt, oppløsningen økte over tid med forbedring av kvaliteten på linsene samt forstørrelseskraften.
I 1930 ble den submikroskopiske verden utvidet med opprettelsen av elektronmikroskopet, hvis hovedforskjell til det optiske mikroskopet er økningen på 1000 ganger mer i forstørrelsesfasen av det observerte materialet, ledsaget av en bedre oppløsningskapasitet som genererer bedre definisjon og forstørrelse i mikroskopisk verden.
Det er to typer grunnleggende elektronmikroskop , begge ble oppfunnet samtidig, men de oppfyller forskjellige funksjoner, disse er:
- Overføringselektronmikroskop (MET): dette er ansvarlig for å projisere elektroner gjennom et tynt lag av materiale eller vev som skal observeres, og gjenspeiler et bilde på en fosforescerende skjerm.
- Skannelektronmikroskop (SEM): Dette gir et bilde som gir inntrykk av å være i tre dimensjoner. Dette mikroskopet bruker tre eller to punkter der elektronene i prøven ankommer for å skanne overflaten av prøven som skal observeres.
De fleste av pionerene innen elektronmikroskopi innen biologi lever fortsatt, og de viktigste er: Albert Claude, Earnest Fullam, Don Fawcett, Charles Leblond, John Luft, Daniel Pease, Keith Porter og George Palade.
