Uttrykket religiøs intoleranse refererer til en form for intoleranse mot religiøs tro eller praksis eller, hvis ikke, mangelen på slike skikker, som en person eller gruppe har. Dette kan være forårsaket av flere faktorer, blant dem kan nevne det faktum at de har forskjellige religiøse trosretninger, har en annen ideologi, så vel som det enkle faktum å ha en antireligiøs følelse. Denne typen holdninger kan til og med føre til aggresjonfysisk, verbal, psykologisk, blant andre. Et tydelig eksempel på denne typen intoleranse i religiøs forfølgelse som oppleves i forskjellige deler av verden i dag. Hovedårsaken til at denne typen holdninger fra samfunnets side finner sted, skyldes hovedsakelig fraværet av religiøs toleranse, religionsfrihet og pluralisme når det gjelder religion.
Det er viktig å merke seg at det ikke er noen eneste årsak som forklarer religiøs intoleranse, men det er mulig å snakke om et veldig generalisert argument blant de som utøver en religion og er intolerante mot andre. Dette argumentet er veldig enkelt: generelt anser alle at deres religion er den sanne, av den grunn er det normalt å motsette dem som forsvarer falske doktriner, fra deres synspunkt.
Dette er et like gammelt fenomen som religionens rette opprinnelse. I eldgamle tider da de første kristne gjennomførte ritualene sine, måtte de gjemme seg i katakombene siden de romerske myndighetene på den tiden ikke tolererte en slik tro. Siden eldgamle tider har det jødiske folket vært offer for forfølgelse i mange øyeblikk av historien, og hovedmotivasjonen for denne forfølgelsen var nettopp fiendtlighet mot de skikker og tro de opprettholder.
På den annen side ble de kristne kjempet mot de religiøse visjonene til de pre-colombianske folket da de ankom det amerikanske kontinentet. Selv innenfor kristendommen selv har det vært tilfeller av intoleranse overfor andre kristne læresetninger, som er klassifisert som kjetterier eller avvik fra den autentiske troen. Alle disse nevnte tilfellene er et tegn på at avvisning og intoleranse av andres tro har vært en konstant som har skjedd fra uminnelige tider og fortsetter til i dag.