Avføringskultur er definert som en type bakteriologisk analyse som utføres på avføringen. For dette brukes teknikker som fremmer utviklingen av mikroorganismer som er tilstede i avføringsprøvene som tidligere er tatt, ved bruk av et gelatinøst stoff, slik at dette form identifiserer patogener (bakterier, larver, ormer, amøber osv.) som kan være ansvarlige for å forårsake enhver sykdom.
Denne typen undersøkelser brukes ofte til å identifisere patogener i avføringen som generelt er ansvarlige for fordøyelsessystemet og forårsaker infeksjoner i fordøyelseskanalen og diaré. Blant de viktigste bakteriene som en avføringskultur kan oppdage, er blant annet salmonella, Escherichia coli, Shigella, Vibrio cholerae. Tilstedeværelsen av disse midlene i kroppen kan generere symptomer av forskjellige typer som urolig mage, feber, diaré, oppkast etc.
For å utføre denne testen er det nødvendig at prøven tas først, som må være fri for stoffer som endrer den, som urin eller annet toalettpapir. Avføringsprøven kan samles med en plastpose for dette, som kan plasseres på toalettet, eller hvis ikke, et spesielt verktøy for oppsamling, så må den plasseres i en tidligere sterilisert beholder og sendes til laboratoriet. så fort som mulig. Etter dette, i laboratoriet, fortsetter vi med avføringen i en rund beholder, der mikroorganismene må vokse, deretter må veksten overvåkes, og identifikasjonen utføres ved bruk av mikroskoper eller mislykkes det. forskjellige fargeteknikker brukes.
Etter at all prosedyren beskrevet ovenfor er utført, må ansvarlig laboratorieoffiser lage en rapport som beskriver resultatet av analysen, det vil si at den i rapporten må indikere om nivåene av saprofytisk flora er normale eller Nei. Normalt bør normale resultater indikere konsentrasjoner av gramnegative bakterier mellom 50 og 70 prosent, samt 30 til 50 prosent av gram-positive bakterier, uten tilstedeværelse av røde blodlegemer og hvite blodlegemer.